2014年被北控水務集團收購以來，南京市政院堅持將人才發展與技術創新作為企業發展的驅動力，打造業務核心能力。

建院以來，公司獲得國家、部、省、市設計方案獎和優秀設計獎450余項，市級以上科研成果獎和科技進步獎30余項。公司陸續獲得全過程咨詢試點企業、省建筑產業現代化設計推薦企業、江蘇省研究生工作站等榮譽。

公司打造創新平臺，成立九大研究中心，并與清華大學、南京大學、武漢大學、華中科技大學、同濟大學、東南大學、河海大學、南京林業大學等多所重點科研院校達成“產學研”協議與項目合作，依托創新平臺，合作共贏，開展科研項目50余項，授權發明及實用新型專利近50項。